Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RSG1Q9BU20 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RSG1Q9BU20 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms