Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD2Q9BTF0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms