Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTA3Q9BTC8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTA3Q9BTC8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms