Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCM2Q9BSQ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCM2Q9BSQ5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms