Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM47Q9BQJ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms