Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLF1Q9BQI6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms