Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABRG3Q99928 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms