Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD5Q99666 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RGPD5Q99666 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms