Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC5LQ99459 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC5LQ99459 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms