Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCF12Q99081 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCF12Q99081 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms