Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSF3RQ99062 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSF3RQ99062 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms