Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms