Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLCC1Q96S66 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms