Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ALS2Q96Q42 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALS2Q96Q42 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms