Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGAP1Q96PV0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms