Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OPALINQ96PE5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OPALINQ96PE5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms