Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NBPF4Q96M43 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NBPF4Q96M43 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms