Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC74BQ96LY2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC74BQ96LY2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms