Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC41A2Q96JW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms