Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms