Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK5RAP3Q96JB5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms