Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms