Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MVB12AQ96EY5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms