Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUNDC1Q96C34 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms