Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3DQ96BQ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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