Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC47Q96A33 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
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