Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RABGGTAQ92696 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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RABGGTAQ92696 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RABGGTAQ92696 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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