Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3C3Q8NEB9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PIK3C3Q8NEB9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms