Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF248Q8NDW4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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