Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STAG2Q8N3U4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STAG2Q8N3U4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms