Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC47Q8N1G4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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