Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD3Q86VQ6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms