Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTU1Q7Z7A3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTU1Q7Z7A3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTU1Q7Z7A3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTU1Q7Z7A3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms