Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM5Q71RC9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMIM5Q71RC9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms