Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BBS12Q6ZW61 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms