Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LRRC9Q6ZRR7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LRRC9Q6ZRR7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC9Q6ZRR7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms