Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFXL1Q6ZNB6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms