Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED9Q6R2W3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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