Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP135Q66GS9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP135Q66GS9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms