Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF18Q5VWM3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF18Q5VWM3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms