Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPRD2Q5VT52 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPRD2Q5VT52 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms