Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms