Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAMSAP1Q5T5Y3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms