Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf220Q5T0J3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1orf220Q5T0J3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms