Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERC4Q5GLZ8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HERC4Q5GLZ8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms