Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ODF2Q5BJF6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ODF2Q5BJF6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms