Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI3KQ59H18 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms