Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms