Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUSP28Q4G0W2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUSP28Q4G0W2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms