Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTLL9Q3SXZ7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms